docs: remove merged philosophy source files

docs/philosophy/README.md

@@ -207,7 +207,7 @@ ruff + black + pyright(或 mypy) + pytest + hypothesis + pydantic(msgspec可替
 
 **扩展阅读**：
 
-- [`控制论与科学方法论`](控制论与科学方法论.md) - 用“可能性空间/反馈/信息/黑箱/可证伪”解释从试错到收敛的机制
+- [控制论与科学方法论](#控制论与科学方法论) - 用“可能性空间/反馈/信息/黑箱/可证伪”解释从试错到收敛的机制
 
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@@ -552,7 +552,7 @@ README.md      # 概念表/错误语义/验收指标
 
 ## 来源文档整合补充
 
-本节合并 `现象学还原.md`、`辩证法.md` 与 `控制论与科学方法论.md` 的核心内容，源文件保留，便于独立阅读与追溯。
+本节合并原 `现象学还原.md`、`辩证法.md` 与 `控制论与科学方法论.md` 的核心内容，作为哲学方法论的统一入口。
 
 ### 现象学还原用于 Vibe Coding