refactor: skills 目录扁平化，移除分类子目录

- 将 00-元技能、01-AI工具、02-数据库、03-加密货币、04-开发工具、05-生产力 下的技能移至 skills/ 根目录
- 更新 skills/README.md 使用表格进行说明性分类
- 更新 AGENTS.md 目录结构说明

skills/headless-cli/references/index.md

@@ -0,0 +1,15 @@
+# Headless CLI References
+
+> ⚠️ CLI 参数可能随版本更新变化，请以官方文档为准
+
+## 目录
+
+- [gemini-cli.md](./gemini-cli.md) - Gemini CLI 参数
+- [claude-cli.md](./claude-cli.md) - Claude Code CLI 参数
+- [codex-cli.md](./codex-cli.md) - Codex CLI 参数
+
+## 官方文档
+
+- [Gemini CLI](https://github.com/google-gemini/gemini-cli)
+- [Claude Code](https://docs.anthropic.com/en/docs/claude-code)
+- [Codex CLI](https://github.com/openai/codex)