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docs/README.md

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 | [getting-started](./getting-started/) | 从零开始的线性入门教程 | [Vibe Coding 经验](./getting-started/README.md#1-vibe-coding-经验) / [学习地图](./getting-started/README.md#1-学习地图) |
 | [concepts](./concepts/) | 核心概念、问题求解与工程思想 | [核心概念索引](./concepts/README.md) |
-| [philosophy](./philosophy/) | 哲学方法论、思维模型与底层认知模型 | [哲学方法论工具箱](./philosophy/README.md#怎么选) |
+| [philosophy](./philosophy/) | 哲学方法论、思维模型与底层认知模型 | [哲学方法论工具箱](philosophy/README.md#philosophy-methodology-toolbox-怎么选) |
 | [references](./references/) | 工程实践、技术栈、模板和检查清单 | [参考资料索引](./references/README.md#目录定位) |
 | [research](./research/) | 新技术、优秀 repo 与工程范式研究 | [研究笔记索引](./research/README.md) |
 
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 1. [从零开始完整入门](./getting-started/README.md#1-学习地图)
 2. [Vibe Coding 经验](./getting-started/README.md#1-vibe-coding-经验)
-3. [问题求解](./concepts/问题求解.md)
-4. [拼好码](./concepts/拼好码.md)
-5. [工程实践](./references/工程实践.md#顶部导航)
+3. [问题求解](concepts/README.md#concept-problem-solving)
+4. [拼好码](concepts/README.md#concept-glue-coding)
+5. [工程实践](references/README.md#reference-engineering-practice-顶部导航)
 
 ### 开发者路径
 
-1. [拼好码](./concepts/拼好码.md)
-2. [系统构建方法](./concepts/系统构建方法.md)
-3. [技术栈](./references/技术栈.md#顶部导航)
-4. [工程实践](./references/工程实践.md#顶部导航)
+1. [拼好码](concepts/README.md#concept-glue-coding)
+2. [系统构建方法](concepts/README.md#concept-system-building)
+3. [技术栈](references/README.md#reference-technology-stack-顶部导航)
+4. [工程实践](references/README.md#reference-engineering-practice-顶部导航)
 
 ### 思维模型路径
 
-1. [思维模型](./philosophy/思维模型.md)
-2. [组合描述模型](./philosophy/组合描述模型.md)
-3. [编程之道](./philosophy/编程之道.md)
-4. [递归自优化系统](./concepts/递归自优化系统.md)
+1. [思维模型](philosophy/README.md#philosophy-thinking-models)
+2. [组合描述模型](philosophy/README.md#philosophy-compositional-description-model)
+3. [编程之道](philosophy/README.md#philosophy-programming-dao)
+4. [递归自优化系统](concepts/README.md#concept-recursive-self-optimizing-system)
 
 ### AI Agent 读取路径
 
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 2. [docs 目录 AGENTS](./AGENTS.md)
 3. [从零开始完整入门](./getting-started/README.md#1-学习地图)
 4. [Vibe Coding 经验](./getting-started/README.md#1-vibe-coding-经验)
-5. [工程实践](./references/工程实践.md#顶部导航)
+5. [工程实践](references/README.md#reference-engineering-practice-顶部导航)
 6. [AI 引用语料](../assets/ai-citation/README.md)
 
 ## 全部文档索引
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 - [README](./concepts/README.md) - 核心概念索引。
 - [AGENTS](./concepts/AGENTS.md) - 核心概念目录操作规则。
-- [问题求解](./concepts/问题求解.md) - 用目标、现状、差距、标准、约束、对象和路径定义问题。
-- [拼好码](./concepts/拼好码.md) - 复用成熟能力，用胶水代码连接、编排、适配业务流程。
-- [系统构建方法](./concepts/系统构建方法.md) - 自顶向下、自底向上与分而治之的组合使用。
-- [开发范式演进](./concepts/开发范式演进.md) - 软件工程组织方式的演进。
-- [语言层要素](./concepts/语言层要素.md) - 看懂代码需要掌握的语言层要素。
-- [递归自优化系统](./concepts/递归自优化系统.md) - 递归自优化生成系统的形式化模型。
+- [问题求解](concepts/README.md#concept-problem-solving) - 用目标、现状、差距、标准、约束、对象和路径定义问题。
+- [拼好码](concepts/README.md#concept-glue-coding) - 复用成熟能力，用胶水代码连接、编排、适配业务流程。
+- [系统构建方法](concepts/README.md#concept-system-building) - 自顶向下、自底向上与分而治之的组合使用。
+- [开发范式演进](concepts/README.md#concept-development-paradigms) - 软件工程组织方式的演进。
+- [语言层要素](concepts/README.md#concept-language-layers) - 看懂代码需要掌握的语言层要素。
+- [递归自优化系统](concepts/README.md#concept-recursive-self-optimizing-system) - 递归自优化生成系统的形式化模型。
 
 ### philosophy
 
-- [README](./philosophy/README.md#怎么选) - 哲学方法论工具箱。
+- [README](philosophy/README.md#philosophy-methodology-toolbox-怎么选) - 哲学方法论工具箱。
 - [AGENTS](./philosophy/AGENTS.md) - 哲学方法论目录操作规则。
-- [思维模型](./philosophy/思维模型.md) - 可复用思维模型索引。
-- [组合描述模型](./philosophy/组合描述模型.md) - 用对象、状态、快照、序列、过程、变换、同一/差异与关系描述复杂系统。
-- [编程之道](./philosophy/编程之道.md) - 编程哲学与工程判断。
+- [思维模型](philosophy/README.md#philosophy-thinking-models) - 可复用思维模型索引。
+- [组合描述模型](philosophy/README.md#philosophy-compositional-description-model) - 用对象、状态、快照、序列、过程、变换、同一/差异与关系描述复杂系统。
+- [编程之道](philosophy/README.md#philosophy-programming-dao) - 编程哲学与工程判断。
 
 ### references
 
 - [README](./references/README.md) - 参考资料索引。
 - [AGENTS](./references/AGENTS.md) - 参考资料目录操作规则。
-- [工程实践](./references/工程实践.md#顶部导航) - 项目架构、代码组织、开发经验、质量门禁与常见坑。
-- [技术栈](./references/技术栈.md#顶部导航) - 技术栈选型、组合案例与初学者学习路径。
+- [工程实践](references/README.md#reference-engineering-practice-顶部导航) - 项目架构、代码组织、开发经验、质量门禁与常见坑。
+- [技术栈](references/README.md#reference-technology-stack-顶部导航) - 技术栈选型、组合案例与初学者学习路径。
 
 ### research
 
 - [README](./research/README.md) - 研究笔记索引。
 - [AGENTS](./research/AGENTS.md) - 研究笔记目录操作规则。
-- [Harness 工程解析](./research/Harness工程解析.md) - Harness Engineering 的工程控制、评估器与反馈闭环解析。
+- [Harness 工程解析](research/README.md#research-harness-engineering) - Harness Engineering 的工程控制、评估器与反馈闭环解析。
 
 ## 维护规则