docs: add directory governance docs

tools/AGENTS.md

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+# tools/ Agent 指南
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+本目录维护辅助工具、外部工具入口和工具配置。
+
+## 职责
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+- `tools/config/`：工具与开发环境配置基线。
+- `tools/prompts-library/`：提示词 Excel、Markdown、JSONL 转换工具。
+- `tools/chat-vault/`：AI 聊天记录保存工具。
+- `tools/external/`：第三方工具、外部仓库和 Git submodule。
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+## 约束
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+- 不把大型第三方源码直接复制进主仓库；新增外部仓库默认使用 submodule。
+- 不在工具配置中提交真实密钥、Token 或个人凭证。
+- 修改工具行为时，同步更新对应 README、AGENTS 和根目录命令说明。
+- 外部源码目录除非任务明确要求，否则不要顺手格式化或批量替换。